Az obszervatórium alapításakor Gothard Jenő szakkönyvtára saját bevallása szerint igen szegényes volt. Az évek során a kutatásaihoz és szerteágazó tevékenységéhez szükséges korabeli szakirodalom legújabb művei mellett sok antik ritkasággal is gyarapította könyvtárát. Ezek közül a legértékesebbek a következők. (A számokra kattintva a művek egy-egy oldalát is megtekinthetjük.)
- J. Bayer: Uranometria (Ulm, 1661) (1)
- G.B. Ricciolo: Almagestum novum (Bologna, 1651) (1), (2)
- G.B. Ricciolo: Astronomia reformata (Bologna, 1665) (1), (2)
- J. Hevelius: Selenographia (Gedani, 1647) (1), (2), (3), (4), (5), (6)
- Ch. Scheiner: Rosa Ursina, sive Sol ... (Bracciano, 1630) (1)
- A. Curtius: Historia coelestis ... (Augsburg, 1666) (1), (2)
- I.J. Marinonio: De astronomica specula domestica ... (Vienna, 1745) (1)